华西医院实验医学科临床分子诊断实验室又为华西临床医学院医学检验系分子生物学检验技术教研室。本实验室现有专业检验技术人员23人，高级职称5名，中级职称7名，博士生导师1名，其中博士后1人，具有博士学位4人，硕士学位10人。 

临床分子诊断实验室拥有先进的分子诊断设备，如普通PCR仪、实时荧光定量PCR仪、全自动核酸提取系统、全自动病毒核酸检测系统、液态芯片系统、基因分析仪、琼脂糖凝胶电泳系统和蔡司全自动核型分析系统等。现开展检测项目共115项，日均标本量约800-1000，检测项目涉及多个领域，包括病原微生物、移植配型、遗传病、血液病、精准医疗和法医物证等，其项目有HBV-DNA定量与基因分型、HBV耐药突变分析、HCV-RNA定量与基因分型、HIV-RNA定量、性传播疾病相关病原体DNA定性检测、HCMV-DNA定量、TB-DNA定性及耐药基因检测、人HLA基因分型、HLA抗体分析、遗传疾病的基因检测、血液病相关融合基因筛选及定量分析、27型人乳头瘤病毒检测、亲子鉴定、个体识别、骨髓与外周血染色体核型分析、药物相关基因检测、循环肿瘤DNA用药基因检测、循环肿瘤细胞叶酸受体检测、乳腺癌遗传相关基因检测、ALL相关16种基因突变检测、AML/MPN/MDS相关34种基因突变检测、髓系58种基因突变检测等，为疾病预防、早期诊断、临床治疗方案确定和疗效判断提供帮助。 

临床分子诊断实验室以优异成绩于2006年6月首次通过了美国CAP医学实验室认可，并于 2008年、2010年、2012年、2014年、2016年和2018年再次以优异成绩通过了美国CAP医学实验室认可复审。 

临床分子诊断实验室近年来承担了国家自然科学基金9项，省部级基金5项，成都市科技局校院地协同创新工程项目1项，成都市科技局转化基金1项，科技部“十四五重大传染病专项” 子课题1项，累计科研经费1000余万元。在各级学术期刊上发表论文200余篇，其中SCI收录文章80余篇。累计向国际顶级学术会议